El 23 en cada Liga se disputará un partido según fixture. Encuentros que se repetirán cada miércoles. Cabe destacar que la Copa Jujuy es organizada por la Municipalidad de San Pedro con el auspicio del Gobierno de la Provincia que se hará cargo del pago de las ternas arbitrales, seguridad, traslado a partir de la Segunda Fase y también de premios en efectivo para los equipos ganadores en cada Liga a partir de esta instancia.
A efectos de un ingreso extra a las arcas de los clubes, el local se quedará con la recaudación. Los ocho equipos de cada Liga participante se detallan a continuación:
Liga Puneña: Santa Clara; General Lavalle, Atlético Argentino. El miércoles y jueves definirán las cinco plazas restantes.
Liga Jujeña: Ciudad de Nieva; Atlético Gorriti; Asociación Atlética La Viña; General Lavalle, Alto Juniors; Deportivo Luján; Atlético Cuyaya; Atlético Palpalá.
Liga Departamental: Sportivo Rivadavia; Deportivo Pampa Blanca; Monterrico San Vicente; Santo Domingo; Atlético El Carmen; Atlético El Carril; Juventud Puesto Viejo.
Liga del Ramal: Atlético La Esperanza; Atlético San Pedro; Río Grande; Deportivo La Merced; Atlético Providencia; Atlético El Polo; Atlético Independiente (San Pedro); Deportivo Parapetí.
Liga Regional: Herminio Arrieta; Deportivo El Constructor; Atlético El Talar; Sportivo Alberdi; Mitre de Calilegua; Defensores de Yuto; Unión Calilegua; Defensores de Fraile Pintado.
Fase Preliminar
Los partidos de esta instancia se jugarán entre clubes de una misma Liga, por lo tanto se determinará en qué estadios se jueguen.
Se enfrentarán: Equipo 1 vs. Equipo 8; Equipo 2 vs. Equipo 7; Equipo 3 vs. Equipo 6; Equipo 4 vs. Equipo 5. El mejor clasificado de acuerdo a la tabla general 2017 será visitante en el primer partido.
Primera Etapa (ida y vuelta):
Liga Jujeña:
Partido 1 (23-05 y 20-06): Atlético Palpalá vs. Ciudad de Nieva
Partido 2 (30-05 y 27-06): Deportivo Luján vs. Asoc. Atlética La Viña
Partido 3 (06-06 y 04-07): Atlético Cuyaya vs. Atlético Gorriti
Partido 4 (13-06 y 12-07): Alto Juniors vs. General Lavalle
Los cuatro ganadores pasan a la siguiente instancia.
Liga Departamental:
Partido 1 (23-05 y 20-06): Juventud Puesto Viejo vs. Sportivo Rivadavia
Partido 2 (30-05 y 27-06): Deportivo Los Leones vs. Monterrico San Vicente.
Partido 3 (06-06 y 04-07): Atlético El Carril vs. Deportivo Pampa Blanca
Partido 4 (13-06 y 12-07): Atlético El Carmen vs. Santo Domingo
Los cuatro ganadores pasan a la siguiente instancia
Liga del Ramal:
Partido 1 (23-05 y 20-06): Deportivo Parapetí vs. Atlético La Esperanza
Partido 2 (30-05 y 27-06): Atlético El Polo vs. Río Grande
Partido 3 (06-06 y 04-07): Atlético Independiente vs. Atlético San Pedro
Partido 4 (13-06 y 12-07): Atlético Providencia vs. Deportivo La Merced
Los cuatro ganadores pasan a la siguiente instancia
Liga Regional:
Partido 1 (23-05 y 20-06): Defensores de Fraile Pintado vs. Herminio Arrieta
Partido 2 (30-05 y 27-06): Defensores de Yuto vs. Atlético El Talar
Partido 3 (06-06 y 04-07): Unión Calilegua vs. Deportivo El Constructor
Partido 4 (13-06 y 12-07): Mitre de Calilegua vs. Sportivo Alberdi
Los cuatro ganadores de cada Liga pasarán a la siguiente instancia.
Segunda Etapa (ida y vuelta):
Partido 5 (18-07 y 01-08): Ganador Partido 1 vs. Ganador Partido 2
Partido 6 (25-07 y 08-08): Ganador Partido 3 vs. Ganador partido 4
El mejor clasificado de acuerdo a la tabla general 2017 será visitante en el primer partido. Los dos ganadores por Liga pasarán a la siguiente instancia.